а не ISO как работают? PSN версии игр, игры в папке нормально работают?
ну и в конце концов, как этот самый внешний диск у вас в компе то ведет?
проверяйте ЖД на bad сектора, может он у вас летит.
В другом USB слоте у вас что вставлено? может оно с ЖД конфликтует, и вызывает тупняки (по крайней мере такая фигня происходила у меня когда был подключен джойстик от PS4 и флешка при игре на RetroArch, там то джойстик не находил, то флешка тупила)
Если с ЖД всё в порядке, попробуйте переустановить прошивку, может быть что-то где-то криво встало и теперь не хочет нормально работать.